| 项 目 | 保税物流园区 | 保税区 |
| 国内货物进区视同出口 | YES | NO |
| 打印退税联 | 出口报关完成即可 | 需要跟踪到货物出境 |
| 出境报关 | 一次出境备案 | 两次出境备案 |
| 出口报关 | 一次出口报关 | 一次出口报关和一次进区报关共两次 |
| 卡口 | 无人自动化管理 | 人工Check |
| 区内企业自用设备、办公和生活消费用品的产品认证 | 检验检疫机构免予强制性产品认证,免予实施品质检验 | 检验检疫机构必须强制性产品认证 |
| 集装箱业务 | 可以拆、拼箱,并无堆存时间限制 | 中转集装箱只能整箱进出,并要求14天必须报关 |
| 进口货物分拨配送业务 | 凭担保分批出区,集中报关 | 不能 |
除此以外,保税物流园区还放宽了外汇管理、工商管理,并对仓储物流企业给予税收优惠。特别是张家港保税物流园区还具备“区港合一”的特点,减少了进出境货物的流转环节,有利于加快物流周转速度。